Приветствую.
Я бы начал с проверки питания этих двух микросхем.
2844, насколько помню, то в максимуме до 30В, а 3003 - до 40В.
Уменьшая R16, R23, R26 вы от микросхем ничего не получите в результате. Почему? Эта цепочка стоит уже повсле самих микросхем и является, как бы токоограничивающей на все потребители. А у вас все нормально без потребителей (пропеллер) и все не так нормально при его наличии.
Очень может быть, что у самих микросхем не хватает питания, при такой нагрузке. Вот с этого я бы и начал.
1. Проверить пропеллер на потребяемый ток и при каком напряжении.
2. Транса нет потому, что это "параллельный" стабилизатор (преобразователь) напряжения. У него другой принцып работы.
3. Для нормальной работы этих микросхем вот вам их даташиты
4. Что бы это все дело осмыслить, в ссылке необходимая и достаточная, даже с избытком, информация
5. По всей видимости у вас просто нестабильное питание самих микросхем или неправильная частота ШИМ. Ее посчитайте по формуле на 2844. Эта частота может очень зависить от ее же питания (ножка 7). Это же питание приходит и на 3003.
6. Ну и посмотрите и частоту, и заполнение сигнала работы и 2844, и 3003 осциллографом.
https://files.dp.ua/ru/HXESQ64Px